В 1991г. на базе Челябинской областной  больницы № 2 был организован  «Челябинский областной госпиталь для инвалидов Великой Отечественной войны» приказом Главного управления здравоохранения Челябинского облисполкома № 345 от 27.08.1990 года.
В 28.02.1995 г.  «Челябинский областной госпиталь для инвалидов Великой Отечественной войны» переименован в Государственное учреждение здравоохранения «Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь для ветеранов войн» и является юридическим лицом на основании Устава учреждения, зарегистрированного Постановлением Главы администрации Центрального района г.Челябинска.          
С 09.04.1982 г. областной  больницей №2 и госпиталем  по 03.10.1996 г.   руководил   главный врач  Котов Александр Аверьянович, Заслуженный врач РФ.
С 1996 по 2014 годы госпиталем руководил Альтман Дмитрий Александрович, Заслуженный врач РФ, доктор медицинских наук, председатель некоммерческого партнерства «Медицинская палата Челябинской области», член  Общественной палаты Челябинской области, а также член Общественного Совета при ГУ МВД и Следственного комитета России Челябинской области, депутат Законодательного Собрания Челябинской области.
За время работы ему удалось объединить вокруг себя единомышленников и создать высокопрофессиональный коллектив врачей и сотрудников.         
Госпиталь стал организационно-методическим Центром, сфера интересов которого  – сохранение здоровья и социального долголетия ветеранов,  а также вопросы клинической геронтологии и гериатрии.
С тех пор в госпитале бережно сохраняются  традиции, и в то же время развивают совершенно новые прогрессивные направления медицины.  
В госпитале постоянно улучшается диагностическая база, проводится научная деятельность, совершенствуются методы лечения и реабилитации.
Анализируются проблемы состояния здоровья ветеранов боевых конфликтов, ветеранов ВОВ, пациентов пожилого возраста.
За это время госпиталь для ветеранов войн обрел статус авторитетного медучреждения Челябинской области, специалисты госпиталя работают по современным стандартам, разрабатывая и успешно внедряя авторские методики лечения и реабилитации пациентов.
Челябинский госпиталь ветеранов за годы своего существования посетили в 2000 г. Патриарх Московский  и  Всея Руси Алексий II, заместитель председателя Правительства РФ Матвиенко В.И. , а также заместитель министра здравоохранения РФ Шарапова О.В.
В 2003г. госпиталь посетил председатель Государственной думы Селезнёв Г.Н.
Одна из ярких страниц истории госпиталя связана с международным сотрудничеством коллектива с медицинскими гуманитарными структурами Германии. В начале 90-х годов инвалид Великой Отечественной войны Виктор Максимов из Екатеринбурга обратился за помощью к жителям немецкого города Дрездена, в прошлом преподавателям русского языка – доктору Зюссу и фрау Дандерс и предложил организовать Общество помощи ветеранам войны России. Кульминационным моментом этого сотрудничества явилась официальная встреча российских  ветеранов с немецкой делегацией, подготовленная Челябинским городским Советом ветеранов при поддержке Правительства Челябинской области и Челябинским областным Немецким  культурным Центром.
В 2002 году на Всероссийском конкурсе «Российская организация высокой социальной эффективности» госпиталь был награждён грамотой Правительства Российской Федерации «За достижения в организации социальной работы».
        В 2008 году за выдающиеся заслуги, вклад в развитие науки, медицины и здравоохранения ГУЗ  «Челябинский  областной клинический  терапевтический  госпиталь  для  ветеранов  войн»  награждён  Почётной грамотой Российской Федерации   с занесением во Всероссийский  национальный   Реестр «Сто лучших учреждений системы здравоохранения России».
В 2009 году госпиталь  награждён   Главным управлением по взаимодействию с правоохранительными  и военными органами Челябинской области    Дипломом   в честь Дня медицинского работника за многолетний и неоценимый труд по восстановлению здоровья участников всех войн и боевых действий.
В 2009 году госпиталь стал лауреатом  III Международного конкурса на звание  «Лучшее учреждение стран СНГ по профилактике заболеваний, укреплению здоровья и реабилитации ветеранов войн и участников локальных конфликтов» Лучшее учреждение в номинации «Научное обоснование и внедрение инновационных технологий».  
24  апреля 2010 года   госпиталь  занял  III место среди  госпиталей  России и стал лауреатом  II  Всероссийского конкурса  на звание  «Лучший госпиталь ветеранов войн», посвященный  65- летия  Победы Великой Отечественной войне 1941-1945 годов.
За период 2009 -2010 года деятельность сотрудников госпиталя неоднократно оценивалось  различными общественными организациями  за практическую работу по  медико - социальной  реабилитации ветеранов Великой  Отечественной войны и ветеранов боевых действий такими как:

• Челябинское региональное отделение Всероссийской общественной организации ветеранов (пенсионеров) войны, труда, Вооруженных Сил и правоохранительных органов (Областной Совет  ветеранов)
• Челябинское областное отделение Всероссийской общественной организации ветеранов войн «Боевое Братство»
• Челябинская региональная общественная организация участников боевых действий «Родина»
• Челябинская региональная общественная организация Общероссийской организации инвалидов войны в Афганистане
• Южно-Уральская Ассоциация общественных организаций ветеранов боевых действий «Патриоты Отечества»

    В 2011 году госпиталь стал лауреатом конкурса на звание «Признание» в номинации «За вклад в развитие здравоохранения», ежегодно присуждаемой Челябинской городской Думой и Администрации г.Челябинска. Премия является высшей общественной наградой г. Челябинска за социально значимую деятельность.
В 2016 году  ГБУЗ "Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь ветеранов войн" включен в Национальный реестр "Ведущие учреждения здравоохранения России" на основании предложения Министерства здравоохранения Челябинской области.
Включение в Национальный реестр России  ведущих учреждений  здравоохранения  Челябинской области является признанием деятельности учреждений не только в рамках региона, но и всей России.
В 2016 году по итогам конкурса "Клиника года", организованного изданием "Комсомольская правда" ГБУЗ "Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь ветеранов войн"  стал  победителем конкурса «Клиника года-2016. Южный Урал»
В 2016 году в  рамках совместного проекта Роструда, его территориальных органов и объединений работодателей и профсоюзов "Декларирование деятельности предприятия по реализации трудовых прав работников и работодателей" ГБУЗ "Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь ветеранов войн" вручили  «Сертификат доверия работодателю»
В 2018 году по итогам Всероссийского конкурса госпиталей ветеранов войн, который проходил  с 19 - 20 апреля 2018 года, в рамках V Всероссийского съезда геронтологов и гериатров с международным участием в  г. Москва  ГБУЗ "Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь ветеранов войн" победил в номинации «Доступность специализированной медицинской помощи в стационарных условиях» и был  награжден дипломом «Доступность специализированной медицинской помощи  в стационарных условиях»  и кубком «Лучшему Госпиталю ветеранов войн России».
Сегодня Челябинский областной клинический терапевтический госпиталь для ветеранов войн  является   региональным лечебным учреждением по организации и оказанию медицинской помощи ветеранам войн.
В госпитале работает 356 сотрудников. В их числе 4 Заслуженных врача РФ, 10 кандидатов и 3 доктор медицинских наук; врачи высшей и первой категории составляют 44,0%. Из среднего медицинского персонала высшую и первую категорию имеют 57,4%.
Госпиталь  является  учебной базой  4 –х  кафедр  ГБОУ ВПО «ЮУГМУ» Минздрава РФ:

•   Неврологии;
•   Клинической психологии
•   Офтальмологии;
•   Онкологии, лучевой диагностики, лучевой терапии;

      Госпиталь развернут на 190 коек, имеет 12 лечебно-диагностических отделения, поликлинику на 600 посещений в день.

• Консультативно-диагностический Центр
• Гериатрический Центр
• Областной Центр психосоматической реабилитации участников современных военных локальных конфликтов
• Лаборатория лазерной офтальмохирургии

В апреле 2014 года начальником госпиталя назначена Василенко Татьяна Михайловна, Заслуженный врач РФ, врач    высшей    категории, главный внештатный  гериатр  МЗ ЧО, член общественной палаты Челябинской области, председатель комитета по социальной политике  и здравоохранению. С 28.10.1996 года, в течение 17 лет Татьяна Михайловна работала в госпитале заместителем начальника госпиталя  по лечебной работе.